腸道菌群大概有10^13-10^14，超過人類細胞總和大約30倍，正常情況下，腸道菌群大致分為以下3類：
1、生理性菌群：以專性厭氧菌為主的菌群，主要以雙歧桿菌、消化球菌等細菌為主，生理性菌群在腸道內(nèi)，發(fā)揮了重要的生理性功能，幫助降解食物中的成分，調(diào)節(jié)腸道正常的生理狀態(tài)，維持腸黏膜屏障，參與腸黏膜免疫的調(diào)節(jié)，也參與全身的其它功能，比如可以影響大腦、臟器功能；
2、兼性需氧菌：為條件致病菌，主要有腸桿菌、類桿菌，當腸道環(huán)境發(fā)生變化，比如使用抗菌素，使生理性菌群數(shù)量減少或免疫力發(fā)生變化后，可能會導致感染的發(fā)生，容易在重癥病人出現(xiàn)；
3、致病菌：可以導致腸炎等疾病的細菌，為過路菌，不會在腸道內(nèi)定殖，比如變形桿菌、芽孢梭狀桿菌。由于一些原因，比如食品被這些細菌污染，通過進食進入到腸道，造成腸道感染，比如細菌性痢疾、急性細菌性腸炎。
