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目前臨床上并沒有特別的甲狀腺癌腫瘤標志物，尤其是比較常見的甲狀腺癌，比如甲狀腺乳頭狀癌、濾泡癌，或者是甲狀腺未分化癌等，通常沒有特定的腫瘤學標志物。一般情況下，也不需要用腫瘤標志物鑒別或診斷甲狀腺癌，完全可以通過超聲或者細針穿刺明確甲狀腺癌的性質。

只有較少見的甲狀腺癌有標志物，比如甲狀腺髓樣癌，屬于甲狀腺癌活性腫瘤，而且惡性程度比較高。通常有2個腫瘤學標志物，包括癌胚抗原(CEA)和降鈣素。這2個腫瘤標志物和甲狀腺髓樣癌的惡性程度有一定的相關性，標志物表達水平越高，提示腫瘤惡性程度越高，或者是腫瘤出現(xiàn)淋巴結轉移以及遠處轉移，對此類癌癥的診斷和治療后的復發(fā)，具有比較好的判斷標準。