纖維支氣管鏡可以檢查出的疾病很多，纖維支氣管鏡診斷疾病的方式具體如下：
1、直視：通過纖維支氣管鏡的直視，可以看到氣管、支氣管，尤其是段、段以上的支氣管黏膜的改變，如果有新生物可以直接看到，可以肉眼觀察黏膜管腔是否有狹窄或分泌物，黏膜是否有充血、水腫、潰爛，以及是否有新生物，對診斷氣管、支氣管炎癥、非炎癥的疾病比較有效；
2、活檢：通過纖維支氣管鏡看到氣管、支氣管，尤其是段、段以上的支氣管有新生物、膿液以及黏膜潰爛等改變，尤其是組織學(xué)的改變，可以通過局部的活檢來確診其性質(zhì)。如果是惡性，組織學(xué)病理可以確診是哪一種支氣管肺癌，看不到的地方可以做盲目活檢。倘若在段、段以下某個部位，可以在X線的引導(dǎo)下做盲目活檢或組織學(xué)的檢查，進(jìn)一步明確支氣管、肺部病灶的性質(zhì)；
3、灌洗、刷檢：感染性疾病可以通過刷檢找到致病菌，非感染性疾病通過灌洗、刷檢可以找到相應(yīng)的細(xì)胞，得到組織學(xué)、細(xì)胞學(xué)、免疫組化、免疫指標(biāo)等相關(guān)的證據(jù)。
因此通過纖維支氣管鏡的直視、活檢、刷檢以及肺泡灌洗，可以診斷很多支氣管、肺部的炎癥和非炎癥的疾病。在非炎癥里疾病能診斷支氣管肺癌自身免疫系統(tǒng)的疾病及其它疾病，因此纖維支氣管鏡是呼吸系統(tǒng)鑒別診斷是非常有價值的一種檢查方法。
