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引起腎盂腎炎最常見的致病菌是革蘭氏陰性桿菌，最為多見的是大腸桿菌。革蘭氏陰性桿菌是泌尿系統(tǒng)常見的寄居菌，在健康機體、抵抗力正常時留存于尿道局部的細菌，能夠被尿液及時沖刷，不至于感染。

如果抵抗力下降，伴有喝水減少、排尿減少、尿液對局部沖刷的能力減少時，局部的革蘭氏陰性桿菌容易大量繁殖，并逆行進入膀胱、輸尿管、腎臟，而導致腎盂腎炎。一旦診斷為腎盂腎炎，需要應用敏感、有效的抗菌藥物足療程治療。