肛周膿腫吃藥，只能暫時(shí)的緩解患者的臨床癥狀，而不能治愈肛周膿腫。在臨床上，肛周膿腫的治療包括非手術(shù)治療和手術(shù)治療。非手術(shù)治療主要包括抗生素治療，一般選用對(duì)革蘭陰性桿菌有效的抗生素進(jìn)行診治，而且患者可以進(jìn)行溫水坐浴和局部理療，甚至有些時(shí)候患者可以口服一些緩瀉劑、石蠟油，以減輕排便時(shí)候出現(xiàn)的肛門(mén)疼痛。
患者一旦確診為肛周膿腫，建議早期的行膿腫切開(kāi)引流或盡快進(jìn)行根治手術(shù)。手術(shù)方式因?yàn)榛颊叩哪撃[位置不同，而有所不同，一般來(lái)說(shuō)，比較淺的肛周膿腫，患者的創(chuàng)面比較小，恢復(fù)起來(lái)也比較快；如果肛周膿腫位置比較深，創(chuàng)面相應(yīng)的也比較大，恢復(fù)起來(lái)也比較慢一些。
