反應性關節(jié)炎可能會復發(fā)。大多數(shù)反應性關節(jié)炎的患者具有自愈傾向，病程持續(xù)3-6個月之間，甚至可以長達1-2年，最終病情可以恢復，表現(xiàn)為癥狀完全消失以及不遺留任何后遺癥。但大約有15%的患者會反復的復發(fā)，但是復發(fā)的原因目前并不清楚，是重復感染導致還是病情一直未控制。這部分患者最終可能病程反復遷延，最終轉化為慢性殘毀性關節(jié)炎。
還有一部分患者大約占10%，最終發(fā)展為其他脊柱關節(jié)病，比如銀屑病關節(jié)炎、強直性脊柱炎或者腸病相關性關節(jié)炎，這種類型的關節(jié)炎患者需要長期服用藥物進行治療。
