對(duì)于非淋菌性尿道炎的患者，大多數(shù)患者可以治愈。非淋菌性尿道炎的致病微生物，主要是沙眼衣原體和支原體等。對(duì)于治療選擇的抗生素，也主要是針對(duì)支原體和衣原體，推薦的方案通常是阿奇霉素、多西環(huán)素或者左氧氟沙星，這是目前最常用的藥物。
對(duì)于有些用藥禁忌的孕婦，常常禁忌使用多西環(huán)素或者喹諾酮類的藥物，推薦使用阿奇霉素或者阿莫西林，具體的用藥要在醫(yī)生的指導(dǎo)下進(jìn)行。在治療過程當(dāng)中，應(yīng)當(dāng)對(duì)性伴侶同時(shí)治療，至少治療7天之內(nèi)要停止性生活。
對(duì)于時(shí)常存在癥狀或者癥狀時(shí)常反復(fù)的患者，的確由于治療方案有效的并不多，如果存在治療困難，要針對(duì)原因進(jìn)行分析。如果存在癥狀，但是沒有完全依照最初的治療方案進(jìn)行治療，可以依然采用最初的方案進(jìn)行治療。
如果治療后，與未治療的性伴侶進(jìn)行性生活而導(dǎo)致癥狀復(fù)發(fā)，也可以按照最初的方案進(jìn)行治療。對(duì)于難治性的患者，注意有沒有存在滴蟲感染的可能，可以應(yīng)用甲硝唑進(jìn)行處理。
一般治療的標(biāo)準(zhǔn)是治療以后臨床癥狀消失，無膿性分泌物、尿液澄清、尿沉渣檢測(cè)為陰性、宮頸和尿道的圖片為陰性、支原體衣原體檢測(cè)為陰性，這就是達(dá)到治愈的標(biāo)準(zhǔn)。
