小兒甲狀腺功能亢進的病因復雜，可能與自身免疫、感染、化學或物理性的損傷有關，也可能是由于遺傳因素、基因多態(tài)性因素等引起。
1、由于自身免疫、感染、化學或物理性的損傷，導致甲狀腺激素釋放增加，如自身免疫性甲狀腺病(AITD）的Graves 病、自身免疫性甲狀腺炎等由此引起。
2、遺傳因素，因為本病有顯著的遺傳傾向，單卵孿生子發(fā)病率為30%-35%，雙卵孿生子發(fā)病率為2%-5%。有家族發(fā)病的傾向。
3、基因多態(tài)性因素，如HLA、CTLA4、PTPN22、CD40、IL-2R等基因的多態(tài)性的內部因素，均可發(fā)生甲狀腺功能亢進癥。
4、母體的甲狀腺刺激性抗體（TSAb)可以透過胎盤，刺激胎兒的甲狀腺引起胎兒或新生兒甲狀腺功能亢進癥。
5、其他病因：如細菌感染、性激素、應激等環(huán)境因素參與影響該疾病。
