癲癇主要與暈厥、假性癲癇發(fā)作、發(fā)作性睡病、基底動脈型偏頭痛、短暫性腦缺血發(fā)作和低血糖癥進行鑒別。暈厥是全腦血流量灌注全面下降的一種短暫性意識喪失，會在久站、劇痛、見血、情緒激動、嚴(yán)寒等情況誘發(fā)，在咳嗽、哭泣、大笑、用力憋氣、排便、排尿時也可以誘發(fā)。意識喪失10秒鐘左右，持續(xù)時間比較短，而不會出現(xiàn)強直陣攣等抽搐，可以進行頭部磁共振和腦血管成像，以及腦電圖的檢查進行鑒別。
假性癲癇發(fā)作又稱為癔癥樣的發(fā)作，是一種功能性的疾病，可以做腦電圖進行確診。假性癲癇發(fā)作的患者會在他人在場的時候出現(xiàn)，抽搐發(fā)作的時間會比較長，暗示治療有效。
發(fā)作性睡病可以引起意識喪失和猝倒，容易誤診為癲癇，需要根據(jù)突然發(fā)作的不可抑制性睡眠、睡眠癱瘓、睡眠前幻覺和猝倒癥四聯(lián)征來鑒別。
基底動脈型偏頭痛也可以出現(xiàn)與失神發(fā)作相鑒別的類似情況，基底動脈型偏頭痛在意識喪失前常有夢樣的感覺，偏頭痛為雙側(cè)，多伴有眩暈、共濟失調(diào)、視物模糊、眼球運動障礙等情況出現(xiàn)，腦電圖可以見到診區(qū)的激波。
短暫性腦缺血發(fā)作在腦電圖上沒有癲癇樣的放電情況，有腦血管的狹窄等等可以進行鑒別。低血糖癥可以出現(xiàn)抽搐發(fā)作，測量血糖低于2mmol/L可以進行鑒別診斷。
